Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCBE1Q6UXH8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCBE1Q6UXH8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCBE1Q6UXH8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCBE1Q6UXH8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCBE1Q6UXH8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCBE1Q6UXH8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms