Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIGD3Q6B0B8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIGD3Q6B0B8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TIGD3Q6B0B8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIGD3Q6B0B8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIGD3Q6B0B8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms