Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM5

PRAMEF9, PRAME family member 9/15, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF9Q5VWM5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF9Q5VWM5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF9Q5VWM5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF9Q5VWM5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRAMEF9Q5VWM5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF9Q5VWM5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF9Q5VWM5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.6 ms