Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC01545Q5VT33 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC01545Q5VT33 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01545Q5VT33 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01545Q5VT33 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01545Q5VT33 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms