Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPANXN1Q5VSR9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPANXN1Q5VSR9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPANXN1Q5VSR9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPANXN1Q5VSR9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPANXN1Q5VSR9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPANXN1Q5VSR9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPANXN1Q5VSR9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPANXN1Q5VSR9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPANXN1Q5VSR9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPANXN1Q5VSR9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms