Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RSPH4AQ5TD94 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RSPH4AQ5TD94 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RSPH4AQ5TD94 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RSPH4AQ5TD94 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RSPH4AQ5TD94 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
RSPH4AQ5TD94 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
RSPH4AQ5TD94 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
RSPH4AQ5TD94 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RSPH4AQ5TD94 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RSPH4AQ5TD94 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RSPH4AQ5TD94 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RSPH4AQ5TD94 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RSPH4AQ5TD94 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
RSPH4AQ5TD94 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RSPH4AQ5TD94 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RSPH4AQ5TD94 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
RSPH4AQ5TD94 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RSPH4AQ5TD94 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
RSPH4AQ5TD94 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
RSPH4AQ5TD94 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
RSPH4AQ5TD94 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
RSPH4AQ5TD94 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
RSPH4AQ5TD94 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
RSPH4AQ5TD94 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
RSPH4AQ5TD94 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
RSPH4AQ5TD94 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
RSPH4AQ5TD94 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
RSPH4AQ5TD94 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
RSPH4AQ5TD94 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RSPH4AQ5TD94 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RSPH4AQ5TD94 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RSPH4AQ5TD94 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RSPH4AQ5TD94 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
RSPH4AQ5TD94 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
RSPH4AQ5TD94 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
RSPH4AQ5TD94 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RSPH4AQ5TD94 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
RSPH4AQ5TD94 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
RSPH4AQ5TD94 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
RSPH4AQ5TD94 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
RSPH4AQ5TD94 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
RSPH4AQ5TD94 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
RSPH4AQ5TD94 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
RSPH4AQ5TD94 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
RSPH4AQ5TD94 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
RSPH4AQ5TD94 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
RSPH4AQ5TD94 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
RSPH4AQ5TD94 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
RSPH4AQ5TD94 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
RSPH4AQ5TD94 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
RSPH4AQ5TD94 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
RSPH4AQ5TD94 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
RSPH4AQ5TD94 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
RSPH4AQ5TD94 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
RSPH4AQ5TD94 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
RSPH4AQ5TD94 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
RSPH4AQ5TD94 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
RSPH4AQ5TD94 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms