Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6L9

ERMARD, Endoplasmic reticulum membrane-associated RNA degradation protein, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERMARDQ5T6L9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERMARDQ5T6L9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERMARDQ5T6L9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERMARDQ5T6L9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERMARDQ5T6L9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ERMARDQ5T6L9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERMARDQ5T6L9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ERMARDQ5T6L9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERMARDQ5T6L9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERMARDQ5T6L9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERMARDQ5T6L9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERMARDQ5T6L9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERMARDQ5T6L9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms