Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SWT1Q5T5J6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SWT1Q5T5J6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SWT1Q5T5J6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SWT1Q5T5J6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SWT1Q5T5J6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWT1Q5T5J6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms