Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SAMD9Q5K651 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SAMD9Q5K651 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SAMD9Q5K651 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SAMD9Q5K651 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
SAMD9Q5K651 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
SAMD9Q5K651 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
SAMD9Q5K651 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
SAMD9Q5K651 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
SAMD9Q5K651 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SAMD9Q5K651 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SAMD9Q5K651 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
SAMD9Q5K651 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SAMD9Q5K651 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
SAMD9Q5K651 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
SAMD9Q5K651 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SAMD9Q5K651 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
SAMD9Q5K651 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
SAMD9Q5K651 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
SAMD9Q5K651 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SAMD9Q5K651 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
SAMD9Q5K651 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
SAMD9Q5K651 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
SAMD9Q5K651 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
SAMD9Q5K651 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
SAMD9Q5K651 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
SAMD9Q5K651 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
SAMD9Q5K651 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
SAMD9Q5K651 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
SAMD9Q5K651 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
SAMD9Q5K651 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
SAMD9Q5K651 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SAMD9Q5K651 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SAMD9Q5K651 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SAMD9Q5K651 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SAMD9Q5K651 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SAMD9Q5K651 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SAMD9Q5K651 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SAMD9Q5K651 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SAMD9Q5K651 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SAMD9Q5K651 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SAMD9Q5K651 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SAMD9Q5K651 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
SAMD9Q5K651 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SAMD9Q5K651 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SAMD9Q5K651 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SAMD9Q5K651 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
SAMD9Q5K651 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
SAMD9Q5K651 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
SAMD9Q5K651 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
SAMD9Q5K651 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SAMD9Q5K651 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SAMD9Q5K651 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SAMD9Q5K651 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SAMD9Q5K651 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SAMD9Q5K651 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
SAMD9Q5K651 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
SAMD9Q5K651 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SAMD9Q5K651 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
SAMD9Q5K651 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SAMD9Q5K651 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SAMD9Q5K651 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SAMD9Q5K651 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SAMD9Q5K651 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SAMD9Q5K651 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SAMD9Q5K651 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
SAMD9Q5K651 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
SAMD9Q5K651 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
SAMD9Q5K651 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
SAMD9Q5K651 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SAMD9Q5K651 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SAMD9Q5K651 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
SAMD9Q5K651 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
SAMD9Q5K651 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
SAMD9Q5K651 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
SAMD9Q5K651 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SAMD9Q5K651 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SAMD9Q5K651 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SAMD9Q5K651 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SAMD9Q5K651 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SAMD9Q5K651 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SAMD9Q5K651 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
SAMD9Q5K651 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
SAMD9Q5K651 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SAMD9Q5K651 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
SAMD9Q5K651 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
SAMD9Q5K651 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
SAMD9Q5K651 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SAMD9Q5K651 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SAMD9Q5K651 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
SAMD9Q5K651 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SAMD9Q5K651 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SAMD9Q5K651 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SAMD9Q5K651 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SAMD9Q5K651 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SAMD9Q5K651 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SAMD9Q5K651 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
SAMD9Q5K651 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SAMD9Q5K651 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SAMD9Q5K651 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms