Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM41BQ5BJD5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM41BQ5BJD5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM41BQ5BJD5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM41BQ5BJD5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms