Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFT2D3Q587I9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFT2D3Q587I9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFT2D3Q587I9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFT2D3Q587I9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFT2D3Q587I9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFT2D3Q587I9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms