Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESCO2Q56NI9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESCO2Q56NI9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESCO2Q56NI9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESCO2Q56NI9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESCO2Q56NI9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESCO2Q56NI9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESCO2Q56NI9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESCO2Q56NI9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ESCO2Q56NI9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESCO2Q56NI9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESCO2Q56NI9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ESCO2Q56NI9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESCO2Q56NI9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESCO2Q56NI9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESCO2Q56NI9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESCO2Q56NI9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms