Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC38Q502W7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC38Q502W7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC38Q502W7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC38Q502W7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC38Q502W7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC38Q502W7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC38Q502W7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC38Q502W7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC38Q502W7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC38Q502W7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC38Q502W7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC38Q502W7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC38Q502W7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC38Q502W7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC38Q502W7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms