Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC36A3Q495N2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC36A3Q495N2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC36A3Q495N2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC36A3Q495N2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC36A3Q495N2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC36A3Q495N2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms