Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRIT3Q3SXY7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRIT3Q3SXY7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRIT3Q3SXY7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRIT3Q3SXY7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRIT3Q3SXY7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRIT3Q3SXY7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRIT3Q3SXY7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRIT3Q3SXY7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRIT3Q3SXY7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRIT3Q3SXY7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRIT3Q3SXY7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRIT3Q3SXY7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRIT3Q3SXY7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRIT3Q3SXY7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRIT3Q3SXY7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRIT3Q3SXY7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRIT3Q3SXY7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRIT3Q3SXY7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LRIT3Q3SXY7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
LRIT3Q3SXY7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRIT3Q3SXY7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRIT3Q3SXY7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRIT3Q3SXY7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRIT3Q3SXY7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRIT3Q3SXY7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRIT3Q3SXY7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRIT3Q3SXY7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRIT3Q3SXY7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRIT3Q3SXY7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRIT3Q3SXY7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRIT3Q3SXY7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRIT3Q3SXY7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRIT3Q3SXY7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRIT3Q3SXY7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRIT3Q3SXY7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRIT3Q3SXY7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRIT3Q3SXY7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LRIT3Q3SXY7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRIT3Q3SXY7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRIT3Q3SXY7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRIT3Q3SXY7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRIT3Q3SXY7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRIT3Q3SXY7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRIT3Q3SXY7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRIT3Q3SXY7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRIT3Q3SXY7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRIT3Q3SXY7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRIT3Q3SXY7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LRIT3Q3SXY7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRIT3Q3SXY7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRIT3Q3SXY7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRIT3Q3SXY7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRIT3Q3SXY7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRIT3Q3SXY7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRIT3Q3SXY7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRIT3Q3SXY7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRIT3Q3SXY7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRIT3Q3SXY7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRIT3Q3SXY7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRIT3Q3SXY7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRIT3Q3SXY7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRIT3Q3SXY7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRIT3Q3SXY7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRIT3Q3SXY7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRIT3Q3SXY7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRIT3Q3SXY7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRIT3Q3SXY7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRIT3Q3SXY7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LRIT3Q3SXY7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRIT3Q3SXY7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRIT3Q3SXY7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRIT3Q3SXY7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRIT3Q3SXY7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRIT3Q3SXY7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRIT3Q3SXY7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRIT3Q3SXY7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRIT3Q3SXY7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRIT3Q3SXY7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRIT3Q3SXY7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRIT3Q3SXY7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRIT3Q3SXY7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRIT3Q3SXY7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRIT3Q3SXY7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRIT3Q3SXY7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms