Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLA2G4EQ3MJ16 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLA2G4EQ3MJ16 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLA2G4EQ3MJ16 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PLA2G4EQ3MJ16 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms