Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q1T7F1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q1T7F1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q1T7F1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q1T7F1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q1T7F1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q1T7F1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q1T7F1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q1T7F1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q1T7F1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q1T7F1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q1T7F1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q1T7F1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q1T7F1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q1T7F1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q1T7F1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q1T7F1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q1T7F1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q1T7F1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q1T7F1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q1T7F1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q1T7F1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q1T7F1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q1T7F1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q1T7F1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q1T7F1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q1T7F1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q1T7F1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q1T7F1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q1T7F1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q1T7F1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q1T7F1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q1T7F1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Q1T7F1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Q1T7F1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Q1T7F1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Q1T7F1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Q1T7F1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Q1T7F1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Q1T7F1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Q1T7F1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Q1T7F1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Q1T7F1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Q1T7F1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Q1T7F1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Q1T7F1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Q1T7F1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Q1T7F1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Q1T7F1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Q1T7F1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Q1T7F1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Q1T7F1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Q1T7F1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Q1T7F1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Q1T7F1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q1T7F1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q1T7F1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q1T7F1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q1T7F1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q1T7F1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q1T7F1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q1T7F1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q1T7F1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q1T7F1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q1T7F1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q1T7F1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q1T7F1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q1T7F1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q1T7F1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q1T7F1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q1T7F1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q1T7F1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q1T7F1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q1T7F1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q1T7F1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q1T7F1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q1T7F1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q1T7F1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q1T7F1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q1T7F1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q1T7F1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Q1T7F1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q1T7F1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q1T7F1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q1T7F1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q1T7F1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q1T7F1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q1T7F1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q1T7F1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q1T7F1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q1T7F1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q1T7F1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q1T7F1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q1T7F1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q1T7F1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q1T7F1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q1T7F1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q1T7F1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q1T7F1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q1T7F1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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