Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKN3Q16667 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKN3Q16667 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKN3Q16667 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKN3Q16667 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDKN3Q16667 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDKN3Q16667 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKN3Q16667 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDKN3Q16667 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKN3Q16667 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKN3Q16667 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKN3Q16667 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKN3Q16667 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKN3Q16667 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKN3Q16667 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKN3Q16667 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKN3Q16667 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKN3Q16667 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDKN3Q16667 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDKN3Q16667 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDKN3Q16667 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDKN3Q16667 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms