Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTGISQ16647 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTGISQ16647 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTGISQ16647 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTGISQ16647 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTGISQ16647 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTGISQ16647 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTGISQ16647 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTGISQ16647 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTGISQ16647 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTGISQ16647 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTGISQ16647 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTGISQ16647 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PTGISQ16647 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTGISQ16647 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTGISQ16647 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTGISQ16647 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTGISQ16647 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTGISQ16647 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTGISQ16647 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTGISQ16647 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTGISQ16647 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTGISQ16647 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTGISQ16647 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGISQ16647 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGISQ16647 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGISQ16647 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGISQ16647 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGISQ16647 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTGISQ16647 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTGISQ16647 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTGISQ16647 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms