Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP7Q16576 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBBP7Q16576 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBBP7Q16576 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBBP7Q16576 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBBP7Q16576 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RBBP7Q16576 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBBP7Q16576 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBBP7Q16576 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBBP7Q16576 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBBP7Q16576 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBBP7Q16576 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBBP7Q16576 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP7Q16576 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBBP7Q16576 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP7Q16576 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP7Q16576 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP7Q16576 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP7Q16576 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP7Q16576 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBBP7Q16576 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 323.2 ms