Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LAMA4Q16363 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LAMA4Q16363 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LAMA4Q16363 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LAMA4Q16363 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LAMA4Q16363 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
LAMA4Q16363 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LAMA4Q16363 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMA4Q16363 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMA4Q16363 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMA4Q16363 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMA4Q16363 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LAMA4Q16363 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LAMA4Q16363 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LAMA4Q16363 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
LAMA4Q16363 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LAMA4Q16363 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LAMA4Q16363 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LAMA4Q16363 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LAMA4Q16363 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LAMA4Q16363 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LAMA4Q16363 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LAMA4Q16363 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LAMA4Q16363 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LAMA4Q16363 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LAMA4Q16363 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMA4Q16363 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMA4Q16363 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMA4Q16363 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LAMA4Q16363 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LAMA4Q16363 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LAMA4Q16363 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LAMA4Q16363 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LAMA4Q16363 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LAMA4Q16363 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
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