Protein–RNA interactions for Protein: Q15800

MSMO1, Methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1Q15800 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSMO1Q15800 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MSMO1Q15800 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSMO1Q15800 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MSMO1Q15800 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSMO1Q15800 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSMO1Q15800 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSMO1Q15800 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSMO1Q15800 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSMO1Q15800 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSMO1Q15800 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSMO1Q15800 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSMO1Q15800 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSMO1Q15800 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSMO1Q15800 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSMO1Q15800 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSMO1Q15800 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSMO1Q15800 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MSMO1Q15800 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MSMO1Q15800 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MSMO1Q15800 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSMO1Q15800 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MSMO1Q15800 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MSMO1Q15800 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSMO1Q15800 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MSMO1Q15800 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MSMO1Q15800 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSMO1Q15800 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSMO1Q15800 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSMO1Q15800 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSMO1Q15800 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MSMO1Q15800 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSMO1Q15800 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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