Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NR6A1Q15406 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR6A1Q15406 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR6A1Q15406 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR6A1Q15406 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR6A1Q15406 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR6A1Q15406 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR6A1Q15406 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR6A1Q15406 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR6A1Q15406 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR6A1Q15406 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NR6A1Q15406 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR6A1Q15406 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR6A1Q15406 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR6A1Q15406 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR6A1Q15406 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR6A1Q15406 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR6A1Q15406 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR6A1Q15406 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR6A1Q15406 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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