Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMAD4Q13485 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMAD4Q13485 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMAD4Q13485 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMAD4Q13485 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMAD4Q13485 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMAD4Q13485 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMAD4Q13485 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMAD4Q13485 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMAD4Q13485 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMAD4Q13485 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMAD4Q13485 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMAD4Q13485 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMAD4Q13485 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMAD4Q13485 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMAD4Q13485 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMAD4Q13485 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMAD4Q13485 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMAD4Q13485 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMAD4Q13485 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAD4Q13485 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAD4Q13485 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMAD4Q13485 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMAD4Q13485 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMAD4Q13485 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMAD4Q13485 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMAD4Q13485 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMAD4Q13485 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMAD4Q13485 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMAD4Q13485 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMAD4Q13485 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMAD4Q13485 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMAD4Q13485 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD4Q13485 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD4Q13485 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SMAD4Q13485 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMAD4Q13485 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMAD4Q13485 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMAD4Q13485 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMAD4Q13485 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMAD4Q13485 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMAD4Q13485 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMAD4Q13485 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMAD4Q13485 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMAD4Q13485 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMAD4Q13485 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMAD4Q13485 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMAD4Q13485 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMAD4Q13485 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMAD4Q13485 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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