Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPRL3Q12980 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPRL3Q12980 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPRL3Q12980 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPRL3Q12980 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPRL3Q12980 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPRL3Q12980 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPRL3Q12980 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPRL3Q12980 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPRL3Q12980 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPRL3Q12980 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPRL3Q12980 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPRL3Q12980 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPRL3Q12980 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPRL3Q12980 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPRL3Q12980 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPRL3Q12980 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NPRL3Q12980 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPRL3Q12980 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPRL3Q12980 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPRL3Q12980 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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