Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSBP1Q04837 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSBP1Q04837 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSBP1Q04837 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSBP1Q04837 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSBP1Q04837 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSBP1Q04837 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSBP1Q04837 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSBP1Q04837 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSBP1Q04837 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSBP1Q04837 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SSBP1Q04837 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSBP1Q04837 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSBP1Q04837 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms