Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL6Q02878 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL6Q02878 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPL6Q02878 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPL6Q02878 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RPL6Q02878 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPL6Q02878 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL6Q02878 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL6Q02878 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL6Q02878 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL6Q02878 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL6Q02878 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL6Q02878 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPL6Q02878 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPL6Q02878 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL6Q02878 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL6Q02878 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL6Q02878 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL6Q02878 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPL6Q02878 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPL6Q02878 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL6Q02878 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms