Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1Q01196 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1Q01196 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1Q01196 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1Q01196 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1Q01196 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1Q01196 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1Q01196 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1Q01196 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX1Q01196 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1Q01196 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1Q01196 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1Q01196 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1Q01196 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1Q01196 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNX1Q01196 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1Q01196 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1Q01196 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1Q01196 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNX1Q01196 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1Q01196 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1Q01196 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1Q01196 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNX1Q01196 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX1Q01196 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX1Q01196 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX1Q01196 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1Q01196 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1Q01196 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1Q01196 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1Q01196 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX1Q01196 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX1Q01196 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNX1Q01196 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX1Q01196 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms