Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE1BQ01064 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE1BQ01064 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE1BQ01064 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE1BQ01064 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE1BQ01064 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE1BQ01064 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE1BQ01064 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE1BQ01064 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE1BQ01064 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE1BQ01064 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1BQ01064 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1BQ01064 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1BQ01064 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1BQ01064 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1BQ01064 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1BQ01064 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1BQ01064 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1BQ01064 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE1BQ01064 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE1BQ01064 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE1BQ01064 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms