Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1BQ00975 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1BQ00975 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1BQ00975 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1BQ00975 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1BQ00975 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1BQ00975 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1BQ00975 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1BQ00975 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1BQ00975 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1BQ00975 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1BQ00975 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1BQ00975 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1BQ00975 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1BQ00975 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNA1BQ00975 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1BQ00975 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1BQ00975 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1BQ00975 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1BQ00975 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1BQ00975 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1BQ00975 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1BQ00975 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA1BQ00975 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA1BQ00975 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA1BQ00975 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1BQ00975 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1BQ00975 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1BQ00975 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1BQ00975 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1BQ00975 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1BQ00975 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1BQ00975 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1BQ00975 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1BQ00975 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1BQ00975 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1BQ00975 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA1BQ00975 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1BQ00975 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1BQ00975 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1BQ00975 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1BQ00975 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1BQ00975 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1BQ00975 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1BQ00975 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1BQ00975 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1BQ00975 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1BQ00975 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1BQ00975 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1BQ00975 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1BQ00975 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1BQ00975 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms