Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YBX1P67809 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YBX1P67809 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
YBX1P67809 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YBX1P67809 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBX1P67809 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBX1P67809 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBX1P67809 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBX1P67809 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
YBX1P67809 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBX1P67809 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBX1P67809 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YBX1P67809 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YBX1P67809 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YBX1P67809 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YBX1P67809 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YBX1P67809 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YBX1P67809 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
YBX1P67809 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
YBX1P67809 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBX1P67809 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBX1P67809 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBX1P67809 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
YBX1P67809 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBX1P67809 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBX1P67809 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YBX1P67809 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YBX1P67809 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBX1P67809 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YBX1P67809 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YBX1P67809 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YBX1P67809 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
YBX1P67809 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YBX1P67809 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YBX1P67809 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YBX1P67809 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YBX1P67809 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YBX1P67809 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
YBX1P67809 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YBX1P67809 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YBX1P67809 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YBX1P67809 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YBX1P67809 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YBX1P67809 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
YBX1P67809 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
YBX1P67809 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YBX1P67809 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YBX1P67809 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YBX1P67809 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YBX1P67809 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YBX1P67809 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YBX1P67809 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YBX1P67809 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YBX1P67809 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YBX1P67809 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YBX1P67809 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YBX1P67809 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YBX1P67809 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YBX1P67809 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YBX1P67809 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
YBX1P67809 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YBX1P67809 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YBX1P67809 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YBX1P67809 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YBX1P67809 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YBX1P67809 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YBX1P67809 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YBX1P67809 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YBX1P67809 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YBX1P67809 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YBX1P67809 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YBX1P67809 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YBX1P67809 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YBX1P67809 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
YBX1P67809 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YBX1P67809 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YBX1P67809 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
YBX1P67809 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YBX1P67809 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YBX1P67809 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YBX1P67809 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YBX1P67809 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YBX1P67809 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YBX1P67809 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YBX1P67809 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YBX1P67809 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YBX1P67809 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YBX1P67809 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YBX1P67809 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YBX1P67809 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YBX1P67809 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YBX1P67809 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YBX1P67809 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YBX1P67809 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YBX1P67809 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
YBX1P67809 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
YBX1P67809 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YBX1P67809 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YBX1P67809 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YBX1P67809 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms