Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO1P63165 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMO1P63165 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUMO1P63165 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUMO1P63165 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUMO1P63165 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms