Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2D3P61077 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2D3P61077 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2D3P61077 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2D3P61077 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2D3P61077 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2D3P61077 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2D3P61077 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2D3P61077 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2D3P61077 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2D3P61077 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2D3P61077 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2D3P61077 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2D3P61077 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2D3P61077 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2D3P61077 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2D3P61077 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2D3P61077 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2D3P61077 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2D3P61077 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms