Protein–RNA interactions for Protein: P61006

RAB8A, Ras-related protein Rab-8A, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8AP61006 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB8AP61006 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB8AP61006 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB8AP61006 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB8AP61006 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB8AP61006 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB8AP61006 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB8AP61006 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB8AP61006 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB8AP61006 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB8AP61006 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB8AP61006 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB8AP61006 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB8AP61006 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB8AP61006 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB8AP61006 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAB8AP61006 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB8AP61006 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB8AP61006 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms