Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEFSECP57772 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EEFSECP57772 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EEFSECP57772 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EEFSECP57772 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EEFSECP57772 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EEFSECP57772 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EEFSECP57772 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EEFSECP57772 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EEFSECP57772 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EEFSECP57772 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EEFSECP57772 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EEFSECP57772 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EEFSECP57772 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEFSECP57772 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEFSECP57772 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEFSECP57772 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEFSECP57772 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEFSECP57772 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEFSECP57772 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEFSECP57772 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEFSECP57772 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EEFSECP57772 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEFSECP57772 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEFSECP57772 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEFSECP57772 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEFSECP57772 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EEFSECP57772 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEFSECP57772 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEFSECP57772 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEFSECP57772 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms