Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDDM3BP56851 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EDDM3BP56851 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EDDM3BP56851 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDDM3BP56851 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms