Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RRADP55042 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRADP55042 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRADP55042 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRADP55042 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRADP55042 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRADP55042 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRADP55042 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRADP55042 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRADP55042 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRADP55042 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRADP55042 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRADP55042 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRADP55042 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRADP55042 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRADP55042 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRADP55042 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRADP55042 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRADP55042 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRADP55042 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRADP55042 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRADP55042 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRADP55042 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRADP55042 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRADP55042 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRADP55042 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRADP55042 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRADP55042 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRADP55042 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRADP55042 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRADP55042 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRADP55042 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRADP55042 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRADP55042 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRADP55042 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRADP55042 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRADP55042 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRADP55042 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRADP55042 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRADP55042 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRADP55042 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRADP55042 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRADP55042 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRADP55042 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRADP55042 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRADP55042 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRADP55042 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRADP55042 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRADP55042 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRADP55042 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRADP55042 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRADP55042 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRADP55042 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRADP55042 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRADP55042 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRADP55042 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRADP55042 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRADP55042 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRADP55042 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RRADP55042 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRADP55042 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RRADP55042 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRADP55042 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRADP55042 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRADP55042 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRADP55042 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRADP55042 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRADP55042 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRADP55042 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRADP55042 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRADP55042 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRADP55042 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRADP55042 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRADP55042 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRADP55042 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRADP55042 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRADP55042 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RRADP55042 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRADP55042 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRADP55042 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRADP55042 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRADP55042 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRADP55042 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRADP55042 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRADP55042 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRADP55042 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRADP55042 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRADP55042 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRADP55042 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRADP55042 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRADP55042 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRADP55042 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRADP55042 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRADP55042 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRADP55042 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RRADP55042 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRADP55042 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRADP55042 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRADP55042 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRADP55042 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms