Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EPHB4P54760 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EPHB4P54760 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EPHB4P54760 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EPHB4P54760 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EPHB4P54760 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EPHB4P54760 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EPHB4P54760 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EPHB4P54760 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EPHB4P54760 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EPHB4P54760 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EPHB4P54760 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EPHB4P54760 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EPHB4P54760 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EPHB4P54760 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EPHB4P54760 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EPHB4P54760 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EPHB4P54760 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EPHB4P54760 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EPHB4P54760 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EPHB4P54760 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EPHB4P54760 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EPHB4P54760 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EPHB4P54760 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EPHB4P54760 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EPHB4P54760 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EPHB4P54760 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EPHB4P54760 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EPHB4P54760 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EPHB4P54760 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EPHB4P54760 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EPHB4P54760 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EPHB4P54760 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EPHB4P54760 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EPHB4P54760 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EPHB4P54760 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EPHB4P54760 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EPHB4P54760 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EPHB4P54760 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EPHB4P54760 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
EPHB4P54760 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPHB4P54760 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPHB4P54760 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EPHB4P54760 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EPHB4P54760 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EPHB4P54760 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EPHB4P54760 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EPHB4P54760 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EPHB4P54760 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EPHB4P54760 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EPHB4P54760 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EPHB4P54760 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EPHB4P54760 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPHB4P54760 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms