Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAG1P54619 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAG1P54619 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAG1P54619 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAG1P54619 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAG1P54619 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAG1P54619 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAG1P54619 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAG1P54619 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAG1P54619 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAG1P54619 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAG1P54619 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAG1P54619 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKAG1P54619 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAG1P54619 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAG1P54619 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAG1P54619 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAG1P54619 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAG1P54619 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAG1P54619 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms