Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
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