Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLCN6P51797 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLCN6P51797 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLCN6P51797 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN6P51797 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCN6P51797 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCN6P51797 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN6P51797 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN6P51797 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLCN6P51797 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLCN6P51797 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN6P51797 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN6P51797 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLCN6P51797 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLCN6P51797 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLCN6P51797 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLCN6P51797 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLCN6P51797 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLCN6P51797 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLCN6P51797 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLCN6P51797 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CLCN6P51797 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN6P51797 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN6P51797 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLCN6P51797 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN6P51797 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN6P51797 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLCN6P51797 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLCN6P51797 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLCN6P51797 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLCN6P51797 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLCN6P51797 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLCN6P51797 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms