Protein–RNA interactions for Protein: P51149

RAB7A, Ras-related protein Rab-7a, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7AP51149 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB7AP51149 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB7AP51149 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB7AP51149 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB7AP51149 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB7AP51149 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB7AP51149 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB7AP51149 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB7AP51149 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB7AP51149 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB7AP51149 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB7AP51149 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB7AP51149 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB7AP51149 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB7AP51149 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB7AP51149 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7AP51149 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB7AP51149 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB7AP51149 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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