Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MTHFSP49914 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
MTHFSP49914 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
MTHFSP49914 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
MTHFSP49914 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
MTHFSP49914 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
MTHFSP49914 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
MTHFSP49914 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
MTHFSP49914 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
MTHFSP49914 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
MTHFSP49914 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
MTHFSP49914 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
MTHFSP49914 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
MTHFSP49914 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
MTHFSP49914 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
MTHFSP49914 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
MTHFSP49914 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
MTHFSP49914 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
MTHFSP49914 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
MTHFSP49914 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
MTHFSP49914 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
MTHFSP49914 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
MTHFSP49914 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MTHFSP49914 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MTHFSP49914 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
MTHFSP49914 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms