Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGS4P49798 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGS4P49798 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGS4P49798 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGS4P49798 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGS4P49798 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGS4P49798 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGS4P49798 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGS4P49798 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGS4P49798 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RGS4P49798 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGS4P49798 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGS4P49798 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGS4P49798 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGS4P49798 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RGS4P49798 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGS4P49798 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGS4P49798 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGS4P49798 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGS4P49798 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGS4P49798 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGS4P49798 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGS4P49798 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGS4P49798 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGS4P49798 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGS4P49798 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGS4P49798 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGS4P49798 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGS4P49798 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGS4P49798 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGS4P49798 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGS4P49798 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGS4P49798 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGS4P49798 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGS4P49798 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGS4P49798 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGS4P49798 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGS4P49798 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGS4P49798 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGS4P49798 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RGS4P49798 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGS4P49798 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGS4P49798 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGS4P49798 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGS4P49798 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGS4P49798 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGS4P49798 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGS4P49798 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGS4P49798 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGS4P49798 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RGS4P49798 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGS4P49798 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGS4P49798 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGS4P49798 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGS4P49798 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGS4P49798 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGS4P49798 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGS4P49798 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RGS4P49798 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGS4P49798 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGS4P49798 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGS4P49798 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGS4P49798 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGS4P49798 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGS4P49798 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGS4P49798 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGS4P49798 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGS4P49798 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGS4P49798 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGS4P49798 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGS4P49798 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGS4P49798 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGS4P49798 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGS4P49798 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGS4P49798 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGS4P49798 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGS4P49798 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGS4P49798 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGS4P49798 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGS4P49798 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RGS4P49798 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGS4P49798 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGS4P49798 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGS4P49798 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGS4P49798 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGS4P49798 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGS4P49798 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGS4P49798 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGS4P49798 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGS4P49798 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGS4P49798 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGS4P49798 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGS4P49798 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGS4P49798 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGS4P49798 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGS4P49798 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RGS4P49798 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGS4P49798 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RGS4P49798 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGS4P49798 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms