Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH9A1P49189 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ALDH9A1P49189 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALDH9A1P49189 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALDH9A1P49189 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALDH9A1P49189 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALDH9A1P49189 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALDH9A1P49189 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALDH9A1P49189 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALDH9A1P49189 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH9A1P49189 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH9A1P49189 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH9A1P49189 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALDH9A1P49189 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALDH9A1P49189 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALDH9A1P49189 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALDH9A1P49189 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ALDH9A1P49189 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALDH9A1P49189 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALDH9A1P49189 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALDH9A1P49189 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALDH9A1P49189 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALDH9A1P49189 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms