Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLD2P49005 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD2P49005 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD2P49005 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD2P49005 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLD2P49005 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD2P49005 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD2P49005 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD2P49005 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLD2P49005 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLD2P49005 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD2P49005 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD2P49005 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD2P49005 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLD2P49005 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLD2P49005 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD2P49005 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLD2P49005 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD2P49005 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLD2P49005 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLD2P49005 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLD2P49005 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD2P49005 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD2P49005 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD2P49005 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD2P49005 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD2P49005 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD2P49005 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD2P49005 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLD2P49005 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLD2P49005 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLD2P49005 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLD2P49005 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLD2P49005 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD2P49005 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD2P49005 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD2P49005 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD2P49005 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD2P49005 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD2P49005 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD2P49005 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD2P49005 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLD2P49005 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLD2P49005 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD2P49005 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD2P49005 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD2P49005 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD2P49005 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD2P49005 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD2P49005 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLD2P49005 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD2P49005 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD2P49005 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLD2P49005 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD2P49005 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD2P49005 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD2P49005 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD2P49005 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD2P49005 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD2P49005 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD2P49005 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD2P49005 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD2P49005 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD2P49005 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD2P49005 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD2P49005 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD2P49005 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD2P49005 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD2P49005 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD2P49005 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD2P49005 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD2P49005 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD2P49005 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD2P49005 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD2P49005 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD2P49005 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD2P49005 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD2P49005 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD2P49005 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD2P49005 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD2P49005 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD2P49005 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD2P49005 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD2P49005 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD2P49005 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD2P49005 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD2P49005 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD2P49005 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD2P49005 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD2P49005 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD2P49005 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD2P49005 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD2P49005 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD2P49005 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD2P49005 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLD2P49005 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLD2P49005 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLD2P49005 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLD2P49005 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD2P49005 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms