Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITPNBP48739 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNBP48739 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITPNBP48739 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITPNBP48739 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITPNBP48739 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITPNBP48739 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms