Protein–RNA interactions for Protein: P41595

HTR2B, 5-hydroxytryptamine receptor 2B, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2BP41595 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR2BP41595 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR2BP41595 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTR2BP41595 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR2BP41595 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2BP41595 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms