Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC1P41238 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC1P41238 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC1P41238 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC1P41238 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms