Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HSPA9P38646 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSPA9P38646 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HSPA9P38646 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
HSPA9P38646 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSPA9P38646 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSPA9P38646 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSPA9P38646 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HSPA9P38646 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HSPA9P38646 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HSPA9P38646 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSPA9P38646 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSPA9P38646 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSPA9P38646 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSPA9P38646 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSPA9P38646 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HSPA9P38646 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HSPA9P38646 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPA9P38646 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPA9P38646 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPA9P38646 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPA9P38646 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPA9P38646 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPA9P38646 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPA9P38646 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPA9P38646 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPA9P38646 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HSPA9P38646 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA9P38646 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA9P38646 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA9P38646 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HSPA9P38646 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms